Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDZRN3Q9UPQ7 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDZRN3Q9UPQ7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms