Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
INO80Q9ULG1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
INO80Q9ULG1 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms