Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CGGBP1Q9UFW8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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