Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DKK4Q9UBT3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms