Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
RNF7Q9UBF6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
RNF7Q9UBF6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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