Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFT57Q9NWB7 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFT57Q9NWB7 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms