Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SMC4Q9NTJ3 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SMC4Q9NTJ3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms