Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DUOX2Q9NRD8 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms