Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RAB18Q9NP72 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms