Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYCP2Q9BX26 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYCP2Q9BX26 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms