Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
APOL4Q9BPW4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms