Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMD1Q99460 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD1Q99460 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD1Q99460 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD1Q99460 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.33■■□□□ 1
PSMD1Q99460 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD1Q99460 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD1Q99460 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD1Q99460 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMD1Q99460 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD1Q99460 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD1Q99460 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD1Q99460 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD1Q99460 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD1Q99460 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMD1Q99460 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms