Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
RPS6KC1Q96S38 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms