Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC136Q96JN2 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms