Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
ZBED3Q96IU2 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ZBED3Q96IU2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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