Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SIRT1Q96EB6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms