Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
APOBEC4Q8WW27 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms