Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCDC107Q8WV48 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms