Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEQ0

SNX29, Sorting nexin-29, humanhuman

Predictions only

Length 813 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29Q8TEQ0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
SNX29Q8TEQ0 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SNX29Q8TEQ0 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms