Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATL2Q8NHH9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATL2Q8NHH9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms