Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HECW1Q76N89 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HECW1Q76N89 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms