Protein–RNA interactions for Protein: Q5VST9

OBSCN, Obscurin, humanhuman

Predictions only

Length 7,968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OBSCNQ5VST9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 GRM8-201ENST00000339582 4057 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 WDR47-203ENST00000369962 4199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PSMD11-201ENST00000261712 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC008158.1-201ENST00000578759 3668 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 MOCS1-204ENST00000373188 3358 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PRICKLE1-216ENST00000640132 4278 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
OBSCNQ5VST9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms