Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PKDCCQ504Y2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms