Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TMEM259Q4ZIN3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms