Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SP6Q3SY56 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms