Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
KLHL40Q2TBA0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLHL40Q2TBA0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms