Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC96Q2M329 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
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CCDC96Q2M329 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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CCDC96Q2M329 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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CCDC96Q2M329 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CCDC96Q2M329 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
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