Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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COL24A1Q17RW2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COL24A1Q17RW2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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