Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CRY1Q16526 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CRY1Q16526 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CRY1Q16526 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CRY1Q16526 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CRY1Q16526 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CRY1Q16526 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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CRY1Q16526 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CRY1Q16526 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
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