Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ZFHX3Q15911 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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