Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CACNA1EQ15878 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1EQ15878 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms