Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SCN9AQ15858 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SCN9AQ15858 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SCN9AQ15858 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
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SCN9AQ15858 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCN9AQ15858 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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