Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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SYCP1Q15431 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SYCP1Q15431 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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