Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RIGQ13278 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RIGQ13278 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RIGQ13278 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RIGQ13278 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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