Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TWF1Q12792 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TWF1Q12792 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms