Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PSME1Q06323 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PSME1Q06323 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms