Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CSNK2A1P68400 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CSNK2A1P68400 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms