Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAB1AP62820 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms