Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
HOXA1P49639 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
HOXA1P49639 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms