Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FNTAP49354 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FNTAP49354 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms