Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NESP48681 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NESP48681 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NESP48681 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NESP48681 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NESP48681 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NESP48681 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms