Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
RANGAP1P46060 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RANGAP1P46060 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms