Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CRATP43155 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CRATP43155 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CRATP43155 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms