Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CASP2P42575 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CASP2P42575 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP2P42575 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP2P42575 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP2P42575 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP2P42575 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP2P42575 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP2P42575 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CASP2P42575 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms