Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOBEC1P41238 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms