Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GGCXP38435 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGCXP38435 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGCXP38435 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGCXP38435 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GGCXP38435 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms