Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
NUP214P35658 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NUP214P35658 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NUP214P35658 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP214P35658 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP214P35658 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP214P35658 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP214P35658 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP214P35658 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP214P35658 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP214P35658 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NUP214P35658 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms