Protein–RNA interactions for Protein: P35249

RFC4, Replication factor C subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC4P35249 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RFC4P35249 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RFC4P35249 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RFC4P35249 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RFC4P35249 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms