Protein–RNA interactions for Protein: P29317

EPHA2, Ephrin type-A receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA2P29317 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
EPHA2P29317 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
EPHA2P29317 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.2 ms