Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HMGB2P26583 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms